Госдума, согласившись на создание федерального агентства, которое не только станет учредителем организаций РАН, но и будет распоряжаться всем имуществом Академии, тут же приняла поправку, которой три таких организации из-под него вывела.
Агентству, которое будет утверждать госзадания на проведение фундаментальных и научных исследований с учетом предложений Академии, согласно поправке, не будут подчиняться Дальневосточное, Сибирское и Уральское отделения РАН: ими будет управлять сама Академия.
Все остальные "организации, находящиеся в ведении РАН, РАМН и РАСХН, передаются в ведение федерального органа исполнительной власти, уполномоченного правительством осуществлять функции и полномочия собственника федерального имущества, закрепленного за этими организациями".
Кроме того, депутаты, запретив чиновникам всех уровней власти вмешиваться в научную деятельность академиков, полностью возложило на создаваемое агентство обязанность эту деятельность регулировать. Отказав, тем самым, требованию ученых ввести положение о "двух ключах", то есть о введении двойного подчинения институтов - Академии в научной части и агентству - в хозяйственной части.