Президент России Дмитрий Медведев подписал указ об учреждении знамени ФСКН, а также знамён её территориальных органов. До этого геральдическими знаками ФСКН являлись только эмблема и флаг.
По данным пресс-службы Кремля, в центре полотнища знамени будет герб России, по углам - эмблема самой Службы, вдоль краёв симметрично расположены 12 декоративных золотых звезд. На оборотной стороне помимо прочих элементов будет изображена золотая извивающаяся змея, пронзенная мечом, передает Первый Канал.