Ситуация была тяжелая: в Грузии имеретинский царь, обезумев от страха из-за постоянных набегов лезгин, взбунтовался против российской власти. В Дагестане и на побережье Каспия русским войскам сопутствовал успех, но и здесь было неспокойно. По приказу главнокомандующего Закавказскими силами России графа Ивана Гудовича, генерал Сергей Булгаков двинул свои войска на Баку, в карательных целях. Дело в том, что бакинские татары перед этим в очередной раз подняли мятеж и убили закавказского наместника российской короны генерала от инфантерии Павла Цицианова (грузинского происхождения). 15 (3) октября Баку сдали без боя. Хусейн-Кули- хан бежал в Кубу, его приближенные и жители города принесли присягу российскому царю. С этой даты Бакинское ханство вошло в состав Российской империи.
Генерал Булгаков остановил свой корпус недалеко от города и послал в него парламентеров с предложением, - положиться на милость российского государя и сдаться без боя. Из Баку прибыла депутация от местного хана с ключами от города. 15 (3) октября русские войска вошли в Баку. По приказу Сергея Булгакова солдаты разыскали тело Цицианова и помести его в армянском храме. Русский генерал после формальных мероприятий оставил в городе сильный гарнизон и двинул свои войска на Кубу. Хан Кубинский Шейх-Али не стал дожидаться неприятеля и укрылся в горах, вероятно, туда же последовал и Хусейн-Кули- хан. Жители Кубы присягнули на верность русской короне, но это произошло уже в ноябре.