Университет Шанхайской организации сотрудничества в сентябре 2010 года примет первых студентов-магистров. Такое решение было принято в Пекине 10 марта 2010 года по окончании заседания, посвященному международному сотрудничеству в сфере образования.
Студенты из стран-участниц ШОС - России, Китая, Казахстанаа, Таджикистана и Кыргызстана будут обучаться в своей стране на базе выбранных УШОС вузов, в том числе Московский государственный институт международных отношений, Пекинский университет иностранных языков, Казахский национальный технический университет и другие. Обучение будет осуществляться по пяти направлениям магистратуры: энергетика, экология, IT-технологии, нанотехнологии и регионоведение.
Выпускники УШОС получат два документа об окончании образования: диплом выпускающего вуза и диплом-сертификат УШОС.