Неустановленные преступники проникли в храм на Приморском шоссе(Курортный район Петербурга) в период с 20 часов 4 ноября до девяти утра 5-го. Способ проникновения неизвестен: следов взлома нет.
Злоумышленники похитили сейф, в котором лежали 295 тысяч рублей, а также серебряные изделия общей стоимостью 80 тысяч рублей. Кроме того, пропали три чаши для сбора пожертвований от прихожан.
Общая стоимость ущерба составила 375 тысяч рублей.
Закладка храма была совершена в 1910 году. Часть суммы на строительство выделила императорская казна. Церковь строилась по проекту архитектора Н. Н. Никонова. В 1913 году был освящён придел преподобного Сергия Радонежского, а в 1914 году — весь храм.
30 августа 1988 года была официально зарегистрирована православная община Зеленогорска, которая просила о передаче ей Казанской церкви. Власти не предоставляли помещение, предлагая строительство нового храма. Ходатайство о возвращении церкви поддержали кандидаты в народные депутаты СССР А. А. Собчак и С. М. Подобед. Оно было удовлетворено Исполкомом Ленсовета 5 июня 1989 года.
Первое богослужение было совершено 21 октября 1989 года на ступенях храма, а первая литургия — 21 ноября 1989 года в правом приделе храма в честь Сергия Радонежского.
Основные отделочные работы внутри храма были завершены к 15 апреля 1990 года, и праздничная пасхальная литургия была впервые совершена перед главным престолом.[2] В августе 1990 года состоялось торжественное освящение церкви Патриархом Московским и всея Руси Алексием II.
В 1991 году храм был ограблен, похищено 10 ценных икон. В их числе — храмовая Казанская икона Божией Матери.