Хорошо известно, что муксун в основном встречается в реках Сибири и считается ценной промысловой рыбой – деликатесом. Видимо, поэтому в последние годы его численность резко сократилась из-за массового браконьерского вылова. Особенно страдает популяция этой рыбы в Обской губе в период нерестовой миграции.
Запасы муксуна были подорваны во второй половине 1990‑х – начале 2000-х годов. Тогда объёмы его нелегального промысла в Обской губе достигали 300–600 т в год. Кроме этого рыбу ловили и вполне легально. В результате такая нагрузка привела к перелову. Поэтому в этом году в реках и озёрах Ямало-Ненецкого, Ханты-Мансийского автономных округов и Томской области уже установлен запрет на промышленное освоение муксуна. Минсельхоз готов запретить его промышленный лов и в Обь-Иртышском бассейне. Проект приказа для этого уже готов. В результате ценную рыбу можно будет добывать только в научных и контрольных целях, а также для работ по воспроизводству. Но запрет на промысел является лишь одной из мер по увеличению численности муксуна. Сейчас на нескольких рыбоводных заводах уже выращены или готовятся маточные стада этой рыбы. Однако половая зрелость у муксуна наступает в возрасте 8–10 лет. Так что восстановление его запасов – процесс долгий и трудоёмкий.